Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC1P33527 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC1P33527 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms