Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNA3P32297 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA3P32297 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms