Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA10P31260 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA10P31260 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA10P31260 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA10P31260 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms