Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPOP30536 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TSPOP30536 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPOP30536 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPOP30536 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPOP30536 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPOP30536 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPOP30536 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPOP30536 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPOP30536 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPOP30536 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPOP30536 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPOP30536 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPOP30536 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPOP30536 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPOP30536 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPOP30536 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPOP30536 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPOP30536 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPOP30536 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPOP30536 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPOP30536 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPOP30536 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPOP30536 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPOP30536 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPOP30536 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPOP30536 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPOP30536 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPOP30536 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms