Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTGFP29279 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTGFP29279 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTGFP29279 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTGFP29279 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTGFP29279 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTGFP29279 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTGFP29279 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTGFP29279 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTGFP29279 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTGFP29279 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTGFP29279 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTGFP29279 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTGFP29279 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTGFP29279 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTGFP29279 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTGFP29279 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTGFP29279 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTGFP29279 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTGFP29279 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTGFP29279 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTGFP29279 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTGFP29279 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTGFP29279 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTGFP29279 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTGFP29279 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTGFP29279 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTGFP29279 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTGFP29279 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTGFP29279 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTGFP29279 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTGFP29279 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTGFP29279 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTGFP29279 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTGFP29279 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTGFP29279 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTGFP29279 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTGFP29279 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTGFP29279 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTGFP29279 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTGFP29279 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTGFP29279 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTGFP29279 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTGFP29279 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTGFP29279 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTGFP29279 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTGFP29279 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTGFP29279 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTGFP29279 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTGFP29279 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTGFP29279 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTGFP29279 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTGFP29279 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTGFP29279 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTGFP29279 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTGFP29279 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTGFP29279 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTGFP29279 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTGFP29279 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTGFP29279 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTGFP29279 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTGFP29279 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTGFP29279 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTGFP29279 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTGFP29279 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTGFP29279 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTGFP29279 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTGFP29279 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTGFP29279 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTGFP29279 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTGFP29279 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTGFP29279 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTGFP29279 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTGFP29279 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTGFP29279 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTGFP29279 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTGFP29279 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTGFP29279 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTGFP29279 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTGFP29279 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTGFP29279 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTGFP29279 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTGFP29279 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTGFP29279 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTGFP29279 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTGFP29279 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTGFP29279 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTGFP29279 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTGFP29279 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms