Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms