Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRMP28827 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
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