Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP1P28562 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms