Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms