Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB5P28074 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB5P28074 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms