Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMA4P25789 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms