Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRZ1P23471 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRZ1P23471 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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