Protein–RNA interactions for Protein: P20434

RPB5, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, yeastyeast

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB5P20434 HUL5YGL141W 2733 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 CDC5YMR001C 2118 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YDL162CYDL162C 357 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 MTM1YGR257C 1101 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 SPO11YHL022C 1197 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 PEX15YOL044W 1152 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 RPS7AYOR096W 573 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 SPR2YOR214C 711 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 ATP20YPR020W 348 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YPR136CYPR136C 513 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YBR090CYBR090C 369 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 RIB5YBR256C 717 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 CHO2YGR157W 2610 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 IMD4YML056C 1575 nt2.95□□□□□ -1.94
RPB5P20434 GCD2YGR083C 1956 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 PFK26YIL107C 2484 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 GPM2YDL021W 936 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 LRS4YDR439W 1044 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 GUK1YDR454C 564 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YDR491CYDR491C 492 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 COG7YGL005C 840 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 RPL30YGL030W 318 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 BTN2YGR142W 1233 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 THP2YHR167W 786 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 COQ9YLR201C 783 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YNL303WYNL303W 348 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 VID27YNL212W 2349 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YSP2YDR326C 4317 nt2.94□□□□□ -1.94
RPB5P20434 NTO1YPR031W 2247 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 SNT1YCR033W 3681 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 CAF130YGR134W 3369 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 OAF3YKR064W 2592 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YDL199CYDL199C 2064 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 ARP4YJL081C 1470 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 DTD1YDL219W 453 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 RGI1YER067W 486 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 GTR2YGR163W 1026 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YHR097CYHR097C 1101 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 RGI2YIL057C 495 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YIR040CYIR040C 333 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 CTK2YJL006C 972 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 SUB1YMR039C 879 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 CUP9YPL177C 921 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 snR42snR42 351 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YBR287WYBR287W 1284 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 RCY1YJL204C 2523 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 DOA4YDR069C 2781 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 PCI8YIL071C 1335 nt2.93□□□□□ -1.94
RPB5P20434 TGL2YDR058C 981 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 DPP1YDR284C 870 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YEA4YEL004W 1029 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 CGR1YGL029W 363 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 SNX4YJL036W 1272 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 DLS1YJL065C 504 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 SWD2YKL018W 990 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 RPS30AYLR287C-A 192 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 URA5YML106W 681 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YMR087WYMR087W 855 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 MGE1YOR232W 687 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 TAZ1YPR140W 1146 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 SEC27YGL137W 2670 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 SIN4YNL236W 2925 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 ERG9YHR190W 1335 nt2.92□□□□□ -1.94
RPB5P20434 RPA190YOR341W 4995 nt2.91□□□□□ -1.94
RPB5P20434 PWP2YCR057C 2772 nt2.91□□□□□ -1.94
RPB5P20434 SSE2YBR169C 2082 nt2.91□□□□□ -1.94
RPB5P20434 CDC40YDR364C 1368 nt2.91□□□□□ -1.94
RPB5P20434 MAM1YER106W 909 nt2.91□□□□□ -1.94
RPB5P20434 RPL19BYBL027W 570 nt2.91□□□□□ -1.94
RPB5P20434 YOR203WYOR203W 354 nt2.91□□□□□ -1.94
RPB5P20434 STE23YLR389C 3084 nt2.91□□□□□ -1.94
RPB5P20434 UBP5YER144C 2418 nt2.9□□□□□ -1.94
RPB5P20434 AI3Q0060 1248 nt2.9□□□□□ -1.95
RPB5P20434 NKP1YDR383C 717 nt2.9□□□□□ -1.95
RPB5P20434 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt2.9□□□□□ -1.95
RPB5P20434 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.9□□□□□ -1.95
RPB5P20434 DOG1YHR044C 741 nt2.9□□□□□ -1.95
RPB5P20434 MRPL49YJL096W 486 nt2.9□□□□□ -1.95
RPB5P20434 GPX1YKL026C 504 nt2.9□□□□□ -1.95
RPB5P20434 RPL17AYKL180W 555 nt2.9□□□□□ -1.95
RPB5P20434 LIP2YLR239C 987 nt2.9□□□□□ -1.95
RPB5P20434 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.9□□□□□ -1.95
RPB5P20434 SPO14YKR031C 5052 nt2.9□□□□□ -1.95
RPB5P20434 ENP2YGR145W 2124 nt2.9□□□□□ -1.95
RPB5P20434 VTC4YJL012C 2166 nt2.9□□□□□ -1.95
RPB5P20434 SLY41YOR307C 1362 nt2.89□□□□□ -1.95
RPB5P20434 MIG1YGL035C 1515 nt2.89□□□□□ -1.95
RPB5P20434 snR83snR83 306 nt2.89□□□□□ -1.95
RPB5P20434 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.89□□□□□ -1.95
RPB5P20434 TAM41YGR046W 1158 nt2.89□□□□□ -1.95
RPB5P20434 MRPL9YGR220C 810 nt2.89□□□□□ -1.95
RPB5P20434 YHR180WYHR180W 492 nt2.89□□□□□ -1.95
RPB5P20434 YJL032WYJL032W 315 nt2.89□□□□□ -1.95
RPB5P20434 YJL175WYJL175W 513 nt2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.9 ms