Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRHP20396 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRHP20396 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRHP20396 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRHP20396 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRHP20396 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TRHP20396 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TRHP20396 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRHP20396 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRHP20396 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TRHP20396 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TRHP20396 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRHP20396 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRHP20396 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRHP20396 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRHP20396 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRHP20396 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TRHP20396 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRHP20396 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRHP20396 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRHP20396 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRHP20396 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRHP20396 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRHP20396 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRHP20396 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRHP20396 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRHP20396 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TRHP20396 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRHP20396 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRHP20396 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRHP20396 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRHP20396 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRHP20396 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRHP20396 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRHP20396 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRHP20396 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
TRHP20396 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRHP20396 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
TRHP20396 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRHP20396 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRHP20396 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRHP20396 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRHP20396 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRHP20396 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
TRHP20396 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRHP20396 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRHP20396 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRHP20396 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRHP20396 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TRHP20396 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TRHP20396 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRHP20396 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRHP20396 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRHP20396 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRHP20396 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRHP20396 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRHP20396 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRHP20396 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRHP20396 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRHP20396 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRHP20396 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRHP20396 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRHP20396 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRHP20396 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRHP20396 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRHP20396 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRHP20396 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
TRHP20396 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRHP20396 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRHP20396 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRHP20396 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRHP20396 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRHP20396 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRHP20396 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRHP20396 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRHP20396 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRHP20396 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
TRHP20396 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRHP20396 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRHP20396 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRHP20396 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRHP20396 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRHP20396 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRHP20396 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRHP20396 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRHP20396 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRHP20396 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRHP20396 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRHP20396 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TRHP20396 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRHP20396 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRHP20396 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRHP20396 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRHP20396 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRHP20396 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRHP20396 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TRHP20396 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRHP20396 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRHP20396 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRHP20396 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms