Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms