Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD53P19397 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD53P19397 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CD53P19397 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD53P19397 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD53P19397 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD53P19397 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD53P19397 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD53P19397 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD53P19397 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD53P19397 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD53P19397 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD53P19397 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD53P19397 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD53P19397 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD53P19397 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD53P19397 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD53P19397 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD53P19397 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD53P19397 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD53P19397 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD53P19397 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CD53P19397 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD53P19397 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD53P19397 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD53P19397 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms