Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYN1P17600 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYN1P17600 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYN1P17600 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYN1P17600 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYN1P17600 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYN1P17600 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYN1P17600 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYN1P17600 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYN1P17600 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYN1P17600 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYN1P17600 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYN1P17600 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYN1P17600 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYN1P17600 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYN1P17600 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYN1P17600 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYN1P17600 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYN1P17600 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYN1P17600 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYN1P17600 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYN1P17600 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYN1P17600 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYN1P17600 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYN1P17600 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYN1P17600 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYN1P17600 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYN1P17600 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYN1P17600 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYN1P17600 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYN1P17600 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYN1P17600 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYN1P17600 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYN1P17600 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYN1P17600 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYN1P17600 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYN1P17600 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYN1P17600 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYN1P17600 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYN1P17600 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYN1P17600 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYN1P17600 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYN1P17600 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYN1P17600 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYN1P17600 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYN1P17600 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYN1P17600 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYN1P17600 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms