Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB8P17481 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms