Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA1P17302 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA1P17302 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJA1P17302 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJA1P17302 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA1P17302 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA1P17302 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA1P17302 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA1P17302 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA1P17302 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA1P17302 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA1P17302 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA1P17302 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA1P17302 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA1P17302 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA1P17302 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA1P17302 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA1P17302 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA1P17302 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA1P17302 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA1P17302 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA1P17302 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA1P17302 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA1P17302 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA1P17302 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA1P17302 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA1P17302 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA1P17302 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA1P17302 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA1P17302 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA1P17302 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA1P17302 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA1P17302 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA1P17302 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA1P17302 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA1P17302 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms