Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCFC2P16383 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms