Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CFTRP13569 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CFTRP13569 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CFTRP13569 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CFTRP13569 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CFTRP13569 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CFTRP13569 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CFTRP13569 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CFTRP13569 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CFTRP13569 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CFTRP13569 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CFTRP13569 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CFTRP13569 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CFTRP13569 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CFTRP13569 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFTRP13569 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFTRP13569 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFTRP13569 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFTRP13569 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFTRP13569 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFTRP13569 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CFTRP13569 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFTRP13569 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFTRP13569 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFTRP13569 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFTRP13569 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFTRP13569 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFTRP13569 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFTRP13569 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFTRP13569 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFTRP13569 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
CFTRP13569 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFTRP13569 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFTRP13569 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFTRP13569 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFTRP13569 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CFTRP13569 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CFTRP13569 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CFTRP13569 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CFTRP13569 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CFTRP13569 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CFTRP13569 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CFTRP13569 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CFTRP13569 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CFTRP13569 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CFTRP13569 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CFTRP13569 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CFTRP13569 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CFTRP13569 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
CFTRP13569 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CFTRP13569 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CFTRP13569 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CFTRP13569 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CFTRP13569 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CFTRP13569 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CFTRP13569 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CFTRP13569 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CFTRP13569 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CFTRP13569 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CFTRP13569 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CFTRP13569 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CFTRP13569 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CFTRP13569 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CFTRP13569 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CFTRP13569 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFTRP13569 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFTRP13569 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFTRP13569 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFTRP13569 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFTRP13569 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFTRP13569 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFTRP13569 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFTRP13569 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFTRP13569 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFTRP13569 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFTRP13569 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFTRP13569 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
CFTRP13569 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFTRP13569 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CFTRP13569 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CFTRP13569 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CFTRP13569 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CFTRP13569 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
CFTRP13569 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CFTRP13569 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CFTRP13569 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CFTRP13569 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CFTRP13569 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CFTRP13569 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CFTRP13569 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CFTRP13569 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CFTRP13569 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CFTRP13569 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CFTRP13569 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CFTRP13569 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CFTRP13569 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CFTRP13569 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CFTRP13569 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CFTRP13569 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CFTRP13569 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms