Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGBP11216 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGBP11216 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGBP11216 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGBP11216 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGBP11216 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGBP11216 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGBP11216 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGBP11216 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGBP11216 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGBP11216 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGBP11216 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGBP11216 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGBP11216 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGBP11216 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGBP11216 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGBP11216 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PYGBP11216 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PYGBP11216 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PYGBP11216 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PYGBP11216 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PYGBP11216 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PYGBP11216 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PYGBP11216 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PYGBP11216 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PYGBP11216 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PYGBP11216 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PYGBP11216 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PYGBP11216 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PYGBP11216 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGBP11216 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGBP11216 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGBP11216 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGBP11216 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGBP11216 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGBP11216 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGBP11216 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGBP11216 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGBP11216 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGBP11216 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGBP11216 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGBP11216 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGBP11216 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGBP11216 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms