Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms