Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2CP0DJJ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP2CP0DJJ0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms