Protein–RNA interactions for Protein: P0CX21

YRF1-5, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-5P0CX21 THI22YPR121W 1719 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 CBP1YJL209W 1965 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 LST7YGR057C 729 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 TPT1YOL102C 693 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 YOR392WYOR392W 444 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 ARO7YPR060C 771 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 NUM1YDR150W 8247 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 IXR1YKL032C 1794 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 NCB2YDR397C 441 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 PAU2YEL049W 363 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 PAU12YGR294W 363 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 IKI1YHR187W 930 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 PAU18YLL064C 363 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 PAU6YNR076W 363 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 MRM1YOR201C 1239 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 PAU24YBR301W 363 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 FRM2YCL026C-A 582 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 VPS34YLR240W 2628 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 RKM3YBR030W 1659 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 TOF1YNL273W 3717 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 UTP14YML093W 2700 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-5P0CX21 YBL012CYBL012C 402 nt2.59□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 JID1YPR061C 906 nt2.59□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt2.59□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 UBP6YFR010W 1500 nt2.58□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 YJL181WYJL181W 1836 nt2.58□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 SOL3YHR163W 750 nt2.58□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 PSR1YLL010C 1284 nt2.58□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 MDM20YOL076W 2391 nt2.58□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 MDS3YGL197W 4464 nt2.57□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 MET6YER091C 2304 nt2.57□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 CSF1YLR087C 8877 nt2.57□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 ADK2YER170W 678 nt2.57□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 YIL024CYIL024C 570 nt2.57□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 TMA22YJR014W 597 nt2.57□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 MMM1YLL006W 1281 nt2.57□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 GPB1YOR371C 2694 nt2.57□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 GGA1YDR358W 1674 nt2.57□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 SPR28YDR218C 1272 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 SDT1YGL224C 843 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 YGR126WYGR126W 693 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 SEC28YIL076W 891 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 YKR078WYKR078W 1758 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 PAC1YOR269W 1485 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 YBT1YLL048C 4986 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 JSN1YJR091C 3276 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 MSH5YDL154W 2706 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 PMT4YJR143C 2289 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 FLO11YIR019C 4104 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 GRR1YJR090C 3456 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 ROY1YMR258C 1662 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 SNU114YKL173W 3027 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 APL2YKL135C 2181 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 TRA1YHR099W 11235 nt2.56□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 NDT80YHR124W 1884 nt2.55□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 TVP15YDR100W 432 nt2.55□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 RAD50YNL250W 3939 nt2.55□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 YGR130CYGR130C 2451 nt2.55□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 FAB1YFR019W 6837 nt2.54□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 KOG1YHR186C 4674 nt2.54□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 PHS1YJL097W 654 nt2.54□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 YLR365WYLR365W 333 nt2.54□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 SLD7YOR060C 774 nt2.54□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 YML096WYML096W 1578 nt2.54□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 CHS1YNL192W 3396 nt2.54□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 SCH9YHR205W 2475 nt2.53□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 LDB17YDL146W 1476 nt2.53□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 DSL1YNL258C 2265 nt2.53□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 SNF11YDR073W 510 nt2.53□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 PEX10YDR265W 1014 nt2.53□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 SPI1YER150W 447 nt2.53□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 ECM13YBL043W 774 nt2.53□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 PDR17YNL264C 1053 nt2.53□□□□□ -2
YRF1-5P0CX21 RNA14YMR061W 2034 nt2.52□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 YDR239CYDR239C 2364 nt2.52□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 YDR203WYDR203W 318 nt2.52□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 SWD3YBR175W 948 nt2.52□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 SEC7YDR170C 6030 nt2.52□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 BCS1YDR375C 1371 nt2.52□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 RTT102YGR275W 474 nt2.51□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt2.51□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 CDC60YPL160W 3273 nt2.51□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 SOK2YMR016C 2358 nt2.51□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 YOS1YER074W-A 258 nt2.51□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 CSI1YMR025W 888 nt2.51□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 TRM732YMR259C 4263 nt2.5□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 ERT1YBR239C 1590 nt2.5□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 YGL132WYGL132W 336 nt2.5□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.5□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 YOR365CYOR365C 2112 nt2.5□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 MUD1YBR119W 897 nt2.5□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 ETP1YHL010C 1758 nt2.5□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 LRE1YCL051W 1752 nt2.5□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 IML1YJR138W 4755 nt2.5□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 PHR1YOR386W 1698 nt2.49□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 AML1YGR001C 747 nt2.49□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt2.49□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 CDC31YOR257W 486 nt2.49□□□□□ -2.01
YRF1-5P0CX21 MAK21YDR060W 3078 nt2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.9 ms