Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms