Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOEP02649 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOEP02649 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOEP02649 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOEP02649 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOEP02649 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOEP02649 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APOEP02649 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOEP02649 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APOEP02649 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOEP02649 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOEP02649 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOEP02649 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOEP02649 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOEP02649 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOEP02649 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOEP02649 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOEP02649 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOEP02649 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOEP02649 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOEP02649 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOEP02649 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOEP02649 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOEP02649 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOEP02649 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOEP02649 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOEP02649 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOEP02649 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOEP02649 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOEP02649 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOEP02649 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOEP02649 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOEP02649 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOEP02649 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APOEP02649 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOEP02649 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOEP02649 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOEP02649 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOEP02649 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOEP02649 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOEP02649 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOEP02649 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms