Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASS1P00966 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASS1P00966 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASS1P00966 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASS1P00966 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASS1P00966 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASS1P00966 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASS1P00966 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASS1P00966 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASS1P00966 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASS1P00966 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASS1P00966 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASS1P00966 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASS1P00966 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASS1P00966 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASS1P00966 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASS1P00966 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASS1P00966 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASS1P00966 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ASS1P00966 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASS1P00966 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASS1P00966 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASS1P00966 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASS1P00966 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms