Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P00740 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P00740 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P00740 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P00740 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P00740 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P00740 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P00740 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P00740 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P00740 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P00740 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P00740 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P00740 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P00740 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P00740 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P00740 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P00740 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P00740 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P00740 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P00740 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P00740 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P00740 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P00740 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P00740 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P00740 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P00740 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P00740 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P00740 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P00740 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P00740 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P00740 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P00740 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms