Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF253O75346 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF253O75346 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF253O75346 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms