Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CILPO75339 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CILPO75339 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CILPO75339 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CILPO75339 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CILPO75339 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CILPO75339 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CILPO75339 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CILPO75339 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CILPO75339 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CILPO75339 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CILPO75339 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CILPO75339 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CILPO75339 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CILPO75339 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CILPO75339 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CILPO75339 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CILPO75339 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CILPO75339 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CILPO75339 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CILPO75339 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CILPO75339 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CILPO75339 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CILPO75339 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CILPO75339 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CILPO75339 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CILPO75339 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CILPO75339 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CILPO75339 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CILPO75339 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CILPO75339 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CILPO75339 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CILPO75339 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CILPO75339 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CILPO75339 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CILPO75339 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CILPO75339 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CILPO75339 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CILPO75339 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CILPO75339 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CILPO75339 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CILPO75339 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CILPO75339 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CILPO75339 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CILPO75339 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms