Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SIN3BO75182 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms