Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP3O75154 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms