Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms