Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP9BO43861 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP9BO43861 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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