Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR3O43761 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms