Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ2O43526 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNQ2O43526 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNQ2O43526 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNQ2O43526 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KCNQ2O43526 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNQ2O43526 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNQ2O43526 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNQ2O43526 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNQ2O43526 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNQ2O43526 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ2O43526 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ2O43526 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ2O43526 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ2O43526 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ2O43526 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ2O43526 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ2O43526 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ2O43526 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ2O43526 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ2O43526 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ2O43526 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ2O43526 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ2O43526 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ2O43526 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ2O43526 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ2O43526 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ2O43526 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ2O43526 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ2O43526 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ2O43526 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ2O43526 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ2O43526 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ2O43526 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ2O43526 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ2O43526 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ2O43526 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ2O43526 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ2O43526 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ2O43526 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ2O43526 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ2O43526 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ2O43526 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ2O43526 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ2O43526 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ2O43526 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ2O43526 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms