Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERI3O43414 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERI3O43414 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERI3O43414 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERI3O43414 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERI3O43414 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERI3O43414 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERI3O43414 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERI3O43414 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERI3O43414 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERI3O43414 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERI3O43414 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERI3O43414 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERI3O43414 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERI3O43414 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERI3O43414 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERI3O43414 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERI3O43414 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERI3O43414 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms