Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF3O43395 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms