Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXA2O43364 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms