Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF1O43189 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF1O43189 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF1O43189 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF1O43189 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF1O43189 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF1O43189 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF1O43189 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF1O43189 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF1O43189 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF1O43189 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF1O43189 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF1O43189 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF1O43189 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF1O43189 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF1O43189 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF1O43189 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF1O43189 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF1O43189 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF1O43189 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF1O43189 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF1O43189 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF1O43189 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF1O43189 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF1O43189 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF1O43189 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF1O43189 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF1O43189 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF1O43189 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF1O43189 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF1O43189 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PHF1O43189 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms