Protein–RNA interactions for Protein: O15213

WDR46, WD repeat-containing protein 46, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR46O15213 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR46O15213 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR46O15213 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR46O15213 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR46O15213 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR46O15213 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR46O15213 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR46O15213 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR46O15213 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR46O15213 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR46O15213 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR46O15213 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR46O15213 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR46O15213 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR46O15213 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR46O15213 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR46O15213 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR46O15213 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR46O15213 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR46O15213 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR46O15213 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR46O15213 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR46O15213 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR46O15213 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR46O15213 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR46O15213 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR46O15213 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR46O15213 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR46O15213 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR46O15213 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR46O15213 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR46O15213 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR46O15213 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR46O15213 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR46O15213 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR46O15213 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR46O15213 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR46O15213 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR46O15213 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR46O15213 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR46O15213 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR46O15213 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR46O15213 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR46O15213 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR46O15213 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR46O15213 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR46O15213 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR46O15213 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR46O15213 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR46O15213 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR46O15213 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR46O15213 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR46O15213 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR46O15213 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR46O15213 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR46O15213 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR46O15213 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR46O15213 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR46O15213 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR46O15213 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR46O15213 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR46O15213 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR46O15213 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR46O15213 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR46O15213 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR46O15213 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR46O15213 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms