Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD28O15084 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms