Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAFD1O14545 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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