Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
O00370 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
O00370 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
O00370 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
O00370 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
O00370 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
O00370 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
O00370 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
O00370 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
O00370 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
O00370 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
O00370 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
O00370 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
O00370 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
O00370 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
O00370 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
O00370 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
O00370 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
O00370 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
O00370 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
O00370 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
O00370 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
O00370 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
O00370 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
O00370 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
O00370 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
O00370 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
O00370 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
O00370 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
O00370 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
O00370 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
O00370 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
O00370 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
O00370 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
O00370 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
O00370 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
O00370 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
O00370 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
O00370 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
O00370 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
O00370 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
O00370 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
O00370 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
O00370 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
O00370 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
O00370 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
O00370 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
O00370 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
O00370 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
O00370 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
O00370 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
O00370 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
O00370 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
O00370 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
O00370 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
O00370 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
O00370 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
O00370 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
O00370 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
O00370 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
O00370 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms