Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3CDO00329 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CDO00329 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms