Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIP1O00291 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIP1O00291 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIP1O00291 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIP1O00291 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIP1O00291 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIP1O00291 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIP1O00291 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIP1O00291 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIP1O00291 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIP1O00291 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIP1O00291 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIP1O00291 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIP1O00291 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIP1O00291 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIP1O00291 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIP1O00291 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIP1O00291 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIP1O00291 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIP1O00291 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIP1O00291 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIP1O00291 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIP1O00291 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIP1O00291 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIP1O00291 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HIP1O00291 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIP1O00291 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIP1O00291 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HIP1O00291 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIP1O00291 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIP1O00291 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIP1O00291 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIP1O00291 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIP1O00291 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIP1O00291 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HIP1O00291 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIP1O00291 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIP1O00291 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIP1O00291 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIP1O00291 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIP1O00291 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIP1O00291 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIP1O00291 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIP1O00291 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIP1O00291 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIP1O00291 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIP1O00291 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIP1O00291 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIP1O00291 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIP1O00291 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIP1O00291 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIP1O00291 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIP1O00291 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIP1O00291 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIP1O00291 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIP1O00291 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIP1O00291 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIP1O00291 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIP1O00291 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIP1O00291 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIP1O00291 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIP1O00291 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIP1O00291 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIP1O00291 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIP1O00291 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIP1O00291 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIP1O00291 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIP1O00291 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIP1O00291 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIP1O00291 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIP1O00291 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIP1O00291 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIP1O00291 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIP1O00291 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIP1O00291 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIP1O00291 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIP1O00291 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIP1O00291 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIP1O00291 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIP1O00291 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIP1O00291 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIP1O00291 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIP1O00291 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIP1O00291 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIP1O00291 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIP1O00291 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIP1O00291 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIP1O00291 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HIP1O00291 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIP1O00291 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIP1O00291 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIP1O00291 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HIP1O00291 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIP1O00291 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIP1O00291 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIP1O00291 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIP1O00291 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIP1O00291 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIP1O00291 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIP1O00291 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms