Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMKR1H3BMG3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms