Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25■■□□□ 1.59
B4E1Z4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4E1Z4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
B4E1Z4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
B4E1Z4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4E1Z4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
B4E1Z4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4E1Z4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
B4E1Z4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4E1Z4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4E1Z4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4E1Z4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4E1Z4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4E1Z4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4E1Z4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4E1Z4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4E1Z4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4E1Z4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4E1Z4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4E1Z4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4E1Z4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4E1Z4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4E1Z4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4E1Z4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4E1Z4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4E1Z4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4E1Z4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4E1Z4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4E1Z4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4E1Z4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4E1Z4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4E1Z4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
B4E1Z4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4E1Z4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4E1Z4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4E1Z4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4E1Z4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4E1Z4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
B4E1Z4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
B4E1Z4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
B4E1Z4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
B4E1Z4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
B4E1Z4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
B4E1Z4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
B4E1Z4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
B4E1Z4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
B4E1Z4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
B4E1Z4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
B4E1Z4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
B4E1Z4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
B4E1Z4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
B4E1Z4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
B4E1Z4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
B4E1Z4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
B4E1Z4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
B4E1Z4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4E1Z4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
B4E1Z4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4E1Z4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4E1Z4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4E1Z4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4E1Z4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4E1Z4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
B4E1Z4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4E1Z4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4E1Z4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4E1Z4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4E1Z4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4E1Z4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4E1Z4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4E1Z4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4E1Z4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4E1Z4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
B4E1Z4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4E1Z4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4E1Z4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4E1Z4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4E1Z4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4E1Z4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4E1Z4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4E1Z4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4E1Z4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms