Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DEV8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DEV8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DEV8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DEV8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DEV8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DEV8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DEV8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DEV8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DEV8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DEV8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DEV8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DEV8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DEV8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DEV8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DEV8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DEV8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DEV8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DEV8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4DEV8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DEV8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms